Við Fræðslumiðstöðina er starfrækt fulltrúaráð, skipað einum fulltrúa frá hverjum stofnanda og einum til vara. Fulltrúaráðið er æðsta stjórn miðstöðvarinnar. Hlutverk þess er að ákveða meginþætti í stefnu og starfstilhögun Fræðslumiðstöðvar Vestfjarða.

Fulltrúaráð Fræðslumiðstöðvar Vestfjarða er þannig skipað:

Verkalýðsfélag Vestfirðinga (var áður Alþýðusamband Vestfjarða) 

Ásdís Birna Pálsdóttir, varamaður Margrét Jóhanna Birkisdóttir

Vestfjarðastofa (var áður Atvinnuþróunarfélag Vestfjarða) 
Sigríður Kristjánsdóttir, varamaður Aðalsteinn Óskarsson

Byggðasamlag Vestfjarða um málefni fatlaðs fólks 
Sif Huld Albertsdóttir, varamaður Aðalstein Óskarsson

Félag opinberra starfsmanna á Vestfjörðum 
Ragnheiður Ása Ingvarsdóttir, formaður fulltrúaráðs, varamaður Hálfdán Bjarki Hálfdánsson

Fjórðungssamband Vestfirðinga 
Baldur Smári Einarsson, varamaður Áslaug B. Guttormsdóttir

Menntaskólinn á Ísafirði 
Jón Reynir Sigurvinsson, varamaður Hildur Halldórsdóttir

Náttúrustofa Vestfjarða 
Nancy Bechtloff, varamaður Hulda Birna Albertsdóttir

Útvegsmannafélag Vestfjarða 
Einar Valur Kristjánsson, varamaður Kristján G. Jóakimsson

Vinnuveitendafélag Vestfjarða 
Kristján G. Jóhannsson, varamaður Sigurður Viggósson