Við Fræðslumiðstöðina er starfrækt fulltrúaráð, skipað einum fulltrúa frá hverjum stofnanda og einum til vara. Fulltrúaráðið er æðsta stjórn miðstöðvarinnar. Hlutverk þess er að ákveða meginþætti í stefnu og starfstilhögun Fræðslumiðstöðvar Vestfjarða.

Fulltrúaráð Fræðslumiðstöðvar Vestfjarða er þannig skipað:

Verkalýðsfélag Vestfirðinga (var áður Alþýðusamband Vestfjarða)
Guðrún Sigríður Matthíasdóttir, varamaður Margrét Jóhanna Birkisdóttir

Vestfjarðastofa (var áður Atvinnuþróunarfélag Vestfjarða) 
Sigríður Kristjánsdóttir, varamaður Aðalsteinn Óskarsson

Byggðasamlag Vestfjarða um málefni fatlaðs fólks 
Sif Huld Albertsdóttir, varaformaður fulltrúaráðs, varamaður Aðalsteinn Óskarsson

Kjölur (áður Félag opinberra starfsmanna á Vestfjörðum) 
Ragnheiður Ása Ingvarsdóttir, varamaður Þórunn Sunneva Pétursdóttir

Fjórðungssamband Vestfirðinga 
Dagbjört Hjaltadóttir, varamaður Hrafnhildur Guðbjörnsdóttir

Menntaskólinn á Ísafirði 
Heiðrún Tryggvadóttir, varamaður Hildur Halldórsdóttir

Náttúrustofa Vestfjarða 
Sigurður Halldór Árnason, varamaður Hulda Birna Albertsdóttir

Útvegsmannafélag Vestfjarða 
Einar Valur Kristjánsson, varamaður Kristján G. Jóakimsson

Vinnuveitendafélag Vestfjarða 
Kristján G. Jóhannsson, formaður fulltrúaráðs, varamaður Sigurður Viggósson